SCIENZE BIOLOGICHE, GEOLOGICHE E AMBIENTALIBiologia Sperimentale e ApplicataAnno accademico 2023/2024

9796055 - GENETICA MOLECOLARE E BIOTECNOLOGIE MICROBICHE
Modulo BIOTECNOLOGIE MICROBICHE

Docente: Maria Carmela SANTAGATI

Risultati di apprendimento attesi

Il modulo di BIOTECNOLOGIE MICROBICHE si propone di ampliare ed approfondire le conoscenze di genomica microbica rivolgendo particolare attenzione alla organizzazione genica (whole genome sequencing, uso di database genomici e tools bioinformatici per l’analisi dei dati), alla trascrittomica, al ruolo di elementi genetici mobili, alle modalità di trasferimento genico orizzontale ed alle tecniche di DNA ricombinante indirizzate anche ad una sua applicazione in ambito biotecnologico. Nel corso inoltre, vengono approfondite le conoscenze sul microbiota/microbioma umano con analisi metagenomica e sulla caratterizzazione di ceppi batterici con caratteristiche probiotiche produttori di batteriocine. Seguendo il corso gli studenti maturano inoltre, una comprensione integrata dei fenomeni biologici e una preparazione scientifica avanzata a livello morfologico/funzionale, cellulare/molecolare dei microrganismi

Modalità di svolgimento dell'insegnamento

Lezioni frontali, tutorato, esercitazioni e seminari.

Qualora l'insegnamento venisse impartito in modalità mista o a distanza potranno essere introdotte le necessarie variazioni rispetto a quanto dichiarato in precedenza, al fine di rispettare il programma previsto e riportato nel syllabus.

Prerequisiti richiesti

microbiologia  e genetica 

Frequenza lezioni

Obbligatoria

Contenuti del corso

Genomi microbici, analisi del genoma batterico e caratterizzazione di elementi genici mobili ( trasposoni e plasmidi). Principi di DNA sequencing, mutagenesi, PCR, progettazione di primers, Real-Time PCR indirizzati allo studio della genetica batterica. Uso di tools bioinformatici per l'analisi di dati ottenuti dal sequenziomento di microrganismi. Studio dei sistemi CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) e sue applicazioni. Applicazione della diagnostica molecolare ( DNA ed immunologica, anticorpi monoclonali). Probiotici, batterioterapia e loro applicazioni, analisi di microbiomi. Studio dei sistemi toxin e antitoxin ( TA), sRNA e riboswitch.



Testi di riferimento

Programmazione del corso

 ArgomentiRiferimenti testi
1Sequenziamento ed analisi del genoma batterico ( DNA sequencing; analisi di sequenza, uso di tools bioinformatici, whole genome sequencing).  
2Studi di genomica  indirizzati  allo studio dei nuovi target identificativi in  diagnostica molecolare ( PCR e progettazione di primers, Real-Time PCR)
3caratterizzazione di elementi genici mobili ( trasposoni e plasmidi),  trasferimento genico orizzontale, applicazione in ambito biotecnologico
4Studio dei sistemi CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) e sue applicazionii
5Strategie di mutagenesi sito specifica indirizzati allo studio della genomica batterica
6Bersagli e saggi per scoprire nuovi agenti antibatterici: sistemi Toxin–antitoxin (TA) systems , sRNA, riboswitch
7 Microbiomi, Probiotici e loro applicazioni in batterioterapia

Verifica dell'apprendimento

Modalità di verifica dell'apprendimento

Colloquio orale.

La verifica dell’apprendimento potrà essere effettuata anche per via telematica, qualora le condizioni lo dovessero richiedere.

Informazioni per studenti con disabilità e/o DSA 
A garanzia di pari opportunità e nel rispetto delle leggi vigenti, gli studenti interessati possono chiedere un colloquio personale in modo da programmare eventuali misure compensative e/o dispensative, in base agli obiettivi didattici ed alle specifiche esigenze. E' possibile rivolgersi anche al referente CInAP (Centro per l’integrazione Attiva e Partecipata - Servizi per le Disabilità e/o i DSA) del Dipartimento di Scienze Biomediche e Biotecnologiche.

 

Esempi di domande e/o esercizi frequenti

come si analizza un genoma batterico?

cosa si intente come microbioma e microbiota


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