9799839 - METODOLOGIA DELLA RICERCA 1 2
Modulo Bioinformatica

Il Corso Integrato di Metodologia della Ricerca I ha l’obiettivo di fornire allo/la studente/ssa le basi concettuali, metodologiche e operative indispensabili per comprendere, utilizzare e valutare criticamente la ricerca scientifica in ambito biomedico e sanitario.

Il corso introduce lo/la studente/ssa alla logica del metodo scientifico applicato alla medicina, superando l’approccio centrato sul singolo caso clinico e orientandolo all’analisi di fenomeni osservabili in popolazioni, studi sperimentali e dati complessi. Particolare attenzione è rivolta allo sviluppo del pensiero critico, alla corretta formulazione delle domande di ricerca, alla valutazione della qualità metodologica degli studi e all’interpretazione dei risultati scientifici.

Attraverso l’integrazione di metodo scientifico, statistica medica, bioinformatica e inglese scientifico, il corso mira a sviluppare competenze trasversali fondamentali per la formazione del medico moderno, in grado di leggere e comprendere la letteratura scientifica internazionale, utilizzare dati e strumenti digitali, comunicare risultati scientifici e aggiornarsi in modo autonomo e continuo secondo i principi della medicina basata sulle evidenze.

BIOINFORMATICA

Conoscenza e comprensione

Lo/la studente/ssa acquisirà conoscenze di base sui principali strumenti e metodi della bioinformatica applicati all’analisi di sequenze biologiche, strutture molecolari e dati omici, comprendendo il ruolo dei database biologici pubblici e delle tecniche di analisi del trascrittoma.

Capacità di applicare conoscenza e comprensione

Lo/la studente/ssa sarà in grado di utilizzare strumenti informatici e software dedicati per l’analisi e l’interpretazione di dati biologici, ipotizzando funzioni, relazioni evolutive e caratteristiche strutturali a partire da sequenze di acidi nucleici o proteine.

Autonomia di giudizio

Lo/la studente/ssa svilupperà la capacità di selezionare in modo consapevole gli strumenti bioinformatici più idonei al problema da affrontare, valutando criticamente l’affidabilità dei risultati ottenuti.

Abilità comunicative

Lo/la studente/ssa saprà utilizzare correttamente il linguaggio tecnico della bioinformatica e dell’analisi dei dati biologici, comunicando in modo chiaro procedure e risultati.

Capacità di apprendimento

Lo/la studente/ssa acquisirà le basi teoriche e pratiche per affrontare in autonomia problemi di analisi dei dati biologici e per aggiornarsi sull’evoluzione degli strumenti bioinformatici.

Lezioni frontali e teorico-pratiche, discussione di articoli scientifici, seminari di approfondimento.

Insegnamento cooperativo (studente-docente) tramite condivisione di materiale didattico e supporti multimediali.

Attività integrative con il supporto di tutor.

Conoscenze di base in ambito scientifico, in particolare di logica, matematica elementare e comprensione del testo; conoscenze di base sull'utilizzo del computer e sulla navigazione in internet; conoscenza di base della lingua inglese. 

Il corso è organizzato in lezioni che prevedono una base teorica affiancata a esercitazioni per l’apprendimento dell’uso di programmi di analisi e visualizzazione dei risultati.

Il programma si compone dei seguenti macro argomenti:

• Introduzione al corso e alle modalità di esame
• I dati biomedici, i database, e i metodi di accesso ai dati
• Cartelle cliniche elettroniche e gli standard internazionali per la rappresentazione dei dati biomedici
• Introduzione alla programmazione e le basi del linguaggio Python per la bioinformatica

Anna Tramontano “Bioinformatica”, Zanichelli

Krane, Raymer. “Fondamenti di Bioinformatica” Pearson

Jambeck, Gibas “Developing Bioinformatics Computer Skills, O'Reilly

Pascarella-Paiardini “Bioinformatica” Zanichelli

La valutazione delle conoscenze acquisite viene realizzata in due fasi: una prova scritta seguita da un colloquio. Il voto è espresso in trentesimi fino a un massimo di 30/30 e la lode. Il voto finale è dato dalla media ponderata dei voti ottenuti nelle diverse prove.

La prova scritta consiste in domande a scelta multipla, risoluzione di esercizi e problemi, interpretazioni di testi in lingua inglese che hanno per oggetto gli argomenti dei programmi delle discipline del C.I.. Ogni prova consiste in 10 quesiti tra domande a scelta multipla, esercizi e domande aperte, ad ognuna delle quali sarà assegnato un punteggio massimo di n. 3 punti. Il voto minimo per superare la prova è 18/30.

La prova orale consiste in un colloquio in cui saranno poste domande che vertono su almeno tre diversi argomenti del programma.

Le prove permettono di verificare: i) il livello di conoscenza delle discipline del C.I.; ii) la capacità di applicare tali conoscenze per la risoluzione di problemi specifici inerenti le applicazioni in ambito clinico (problem solvinga autonomia di giudizio); iii) la chiarezza espositiva; iv) la proprietà di linguaggio medico-scientifico. 

Per l’attribuzione del voto finale si terrà conto dei seguenti parametri:

Voto 29-30 e lode: lo studente ha una conoscenza approfondita degli argomenti trattati, riesce prontamente e correttamente a integrare e analizzare criticamente le situazioni presentate, risolvendo autonomamente problemi anche di elevata complessità; ha ottime capacità comunicative e padroneggia il linguaggio medico-scientifico.

Voto 26-28: lo studente ha una buona conoscenza degli argomenti trattati, riesce a integrare e analizzare in modo critico e lineare le situazioni presentate, riesce a risolvere in modo abbastanza autonomo problemi complessi ed espone gli argomenti in modo chiaro utilizzando un linguaggio medico-scientifico appropriato; 

Voto 22-25: lo studente ha una discreta conoscenza degli argomenti trattati, anche se limitata agli argomenti principali; riesce a integrare e analizzare in modo critico ma non sempre lineare le situazioni presentate ed espone gli argomenti in modo abbastanza chiaro con una discreta proprietà di linguaggio; 

Voto 18-21: lo studente ha la minima conoscenza degli argomenti trattati, ha una modesta capacità di integrare e analizzare in modo critico le situazioni presentate ed espone gli argomenti in modo sufficientemente chiaro sebbene la proprietà di linguaggio sia poco sviluppata; 

Esame non superato: lo studente non possiede la conoscenza minima richiesta dei contenuti principali dell’insegnamento. La capacità di utilizzare il linguaggio specifico è scarsissima o nulla e non è in grado di applicare autonomamente le conoscenze acquisite. 

Durante il corso saranno forniti diversi esercizi risolti.

Esercitazioni pratiche in aula faciliteranno la comprensione delle tematiche affrontate.