CHIRURGIA GENERALE E SPECIALITÀ MEDICO-CHIRURGICHEMedicina e chirurgiaAnno accademico 2023/2024

1010664 - MICROBIOLOGIA 3

Docente: Pio Maria FURNERI

Risultati di apprendimento attesi

Il Corso si propone di fornire allo studente gli strumenti conoscitivi e metodologici necessari per comprendere:

  1. I meccanismi di infezione nell'ospite di microrganismi e parassiti;
  2. Le caratteristiche biologiche essenziali dei microrganismi responsabili di infezioni umane;
  3. I meccanismi eziopatogenetici;
  4. Microrganismi responsabili delle infezioni umane
  5. Accertamento diagnostico (cenni) e test di sensibilità in vitro
  6. Strategie di controllo dell’infezione: Antibiotici, sieri e vaccini

In riferimento all’obiettivo di apprendimento dei meccanismi di infezione nell'ospite di microrganismi e parassiti, lo studente dovrà essere in grado di: i) Individuare i diversi tipi di rapporto che microrganismi e parassiti umani determinano con l’ospite, differenziando la colonizzazione dalla malattia; ii) Correlare i meccanismi di aggressione di microrganismi e parassiti con i vari “tipi” di infezione e di lesioni patologiche indotte;  iii) Analizzare i fattori critici che determinano il contagio e la diffusione di microrganismi e parassiti correlandoli con le relative peculiari caratteristiche biologiche;  iv) Distinguere i diversi “tipi” di infezione virale; differenziare un’infezione virale da quella indotta da altri microrganismi e parassiti.

In riferimento all’obiettivo di apprendimento delle caratteristiche biologiche essenziali dei microrganismi e parassiti responsabili di infezioni umane lo studente dovrà essere in grado di: i) Distinguere i microrganismi e parassiti nell’ambito dei vari stadi di aggregazione della materia vivente (metazoi, procarioti, eucarioti, virus), correlando il grado di organizzazione e funzione con l’azione patogena; ii) Correlare il fenomeno della variazione e mutazione dei microrganismi e parassiti con l’azione patogena e la resistenza a sostanze antimicrobiche.

In riferimento all’obiettivo di apprendimento delle relazioni tra microrganismi e l'ambiente, lo studente dovrà essere in grado di: i) Valutare il grado di sopravvivenza nell’ambiente di microorganismi e parassiti quale fattore critico per l’infezione dell’ospite.

In riferimento all’obiettivo di apprendimento delle strategie per il controllo delle malattie da infezione, lo studente dovrà̀ essere in grado di: i) Definire il principio della “tossicità̀ selettiva” finalizzandolo all’uso terapeutico di sostanze antimicrobiche; ii) Descrivere e classificare i meccanismi inibitori, la sede d’azione, lo spettro d’azione di chemio antibiotici, antivirali, sostanze antifungine ed antiprotozoarie; iii) Indicare i meccanismi della chemio-antibiotico resistenza (genotipica e fenotipica) e della resistenza ad altri agenti antimicrobici (antivirali, antifungini, antiprotozoari); iv) Analizzare i limiti della chemioterapia antivirale in rapporto alle caratteristiche biologiche dei virus e patogenetiche dell’infezione virale; v) Valutare le prospettive sperimentali di interferire sulle diverse funzioni di microrganismi e parassiti tramite sostanze inibenti; vi) Definire i vaccini in uso nelle malattie infettive (vaccinoprofilassi / vaccinoterapia);  vii) Definire i sieri immuni (sieroprofilassi e sieroterapia) correlandola con la prevenzione delle infezioni dell’uomo e con la cura di una malattia infettiva; viii) vaccini tradizionali e vaccini ricombinanti elencando quelli attualmente in uso.   

 In riferimento all’obiettivo di accertamento diagnostico e test di sensibilità, lo studente dovrà essere in grado di: i) possedere le conoscenze di base delle metodologie fenotipiche di base e molecolari del laboratorio di microbiologia; ii) conoscere l’antibiogramma, il suo allestimento e la sua lettura ai fini dell’efficacia clinica.

Modalità di svolgimento dell'insegnamento

Lezioni frontali. Qualora l'insegnamento venisse impartito in modalità mista o a distanza potranno essere introdotte le necessarie variazioni rispetto a quanto dichiarato in precedenza, al fine di rispettare il programma previsto e riportato nel syllabus.

Informazioni per studenti con disabilità e/o DSA. A garanzia di pari opportunità e nel rispetto delle leggi vigenti, gli studenti interessati possono chiedere un colloquio personale in modo da programmare eventuali misure compensative e/o dispensative, in base agli obiettivi didattici ed alle specifiche esigenze. E' possibile rivolgersi anche al docente referente CInAP (Centro per l’integrazione Attiva e Partecipata - Servizi per le Disabilità e/o i DSA) del  Dipartimento di Chirurgia Generale e Specialità Medico- Chirurgiche, prof. Vito Leanza

Prerequisiti richiesti

Raggiungimento degli obiettivi formativi previsti dagli insegnamenti propedeutici.

Frequenza lezioni

Obbligatoria

Contenuti del corso


                            BATTERIOLOGIA

                            1.    Batteri di interesse medico: Caratteristiche morfologiche, struttura e funzione dei principali componenti batterici strutturali e biofilm, nozioni di biochimica, fisiologia e genetica microbica;

                            2.    Patogenesi delle dell’infezioni batteriche: Il processo infettivo: dall’adesione all’espressione della virulenza, eradicazione, meccanismi di patogenicità, tossine;

                            3.    Relazione ospite-parassita: Patogeni extra e intracellulari, la risposta dell’ospite;

                            4.   ll controllo dell’infezione: Sterilizzazione, disinfezione, anti-sepsi; Antibiotici, cenni di meccanismi d’azione e di resistenza; Antibiogramma e misure dell’efficacia;

                            5.    La profilassi immunitaria: Sieri immuni e vaccini; Vaccini ottenuti con metodologie tradizionali e ricombinanti;

                            6.    Batteriologia speciale: Tassonomia, Inquadramento tassonomico, caratteristiche, identificazione di laboratorio, meccanismi di patogenicità, manifestazioni cliniche, sensibilità e resistenza agli antibiotici di: Cocchi Gram positivi, Cocchi Gram negativi, Enterobacterales, Bacilli Gram negativi non fermentanti, Micobatteri, Vibrio, Bacilli sporigeni aerobi ed anaerobi, Neisseriae, Streptomyces, Nocardia, Actinomyces, Corynebacterium, Lactobacillus, Listeria, Gardnerella, Clostridium, Haemophilus, Pasteurella, Vibrio, Legionella, Brucella, Bordetella, Bacteroides, Campylobacter, Helicobacter, Mycoplasma, Ureaplasma, anaerobi non sporigeni, spirochete, Chlamydia.

                            7.    I principi di diagnostica delle infezioni da batteri, test di sensibilità fenotipici e molecolari

                            VIROLOGIA

                            1.    I virus e le strutture subvirali

                            a.    L’organizzazione delle particelle virali, replicazione dei virus

                            b.    Patogeni subvirali: prioni, viroidi e virusoidi

                            2.    La patogenesi dell’infezione virale

                            a.    Modalità di trasmissione

                            b.    Tipi d’infezione virale: infezione acuta ed infezione persistente (latente, lenta, cronica e citotrasformante)

                            c.    La risposta dell’ospite all’infezione virale

                            d.    Il sistema interferon

                            3.    Il controllo delle infezioni virali

                            a.    I chemioterapici antivirali

                                                                      i.    Classificazione

                                                                    ii.    Meccanismo d’azione e resistenza

                                                                   iii.    Terapie combinate

                            b.    I vaccini

                            4.    I principi di diagnostica delle malattie virali

                            a.    Metodo colturale

                            b.    Metodi non colturali e molecolari

                            c.    Metodi sierologici

                            5.    Caratteristiche dei principali virus di interesse medico: Poxviridae, Herpesviridae, Adenoviridae, Papillomavirus e Polyomavirus umani, Parvoviridae, Paramyxoviridae, Orthomyxoviridae, Picornaviridae, Arenaviridae, Bunyaviridae, Caliciviridae, Coronaviridae, Filoviridae, Flaviridae, Reoviridae, retrovirus umani, Togaviridae e Rubivirus, virus delle epatiti (HAV, HBV, HCV, HDV, HEV, HGV).

                            MICOLOGIA E PARASSITOLOGIA

                            1.    Caratteristiche generali dei miceti, azione patogena e classificazione delle micosi

                            a.    La cellula fungina

                            b.    Meccanismi di patogenicità (micetismo, micotossicosi, micosi)

                            c.    Patogenesi delle micosi

                            d.    Dimorfismo

                            e.    Modalità di infezione

                            f.     Classificazione delle micosi

                            g.    Difesa dell’ospite alle infezioni micotiche

                            2.    Funghi responsabili di micosi

                            a.    Patogeni opportunisti:

                                                                      i.    Lieviti: CandidaCryptococcusMalasseziaPneumocystis, Saprochaeta

                                                                    ii.    Funghi filamentosi: Mucorales, Entomophtorales, Aspergillus, Fusarium, Lomentospora, feoifomiceti e altri funghi responsabili di micosi sottocutanee

                            b.    Funghi Patogeni primari e dimorfi t.d.

                            3.    Farmaci antifungini

                            a.    Meccanismo d’azione

                            b.    Meccanismo di resistenza

                            4.    Parassiti

                            a.    Caratteristiche morfologiche e meccanismo dell’azione patogena

                            b.    Caratteristiche essenziali e differenziali delle infezioni umane da protozoi ed altri parassiti dell’uomo

                            c.    Le diverse possibilità di contagio e diffusione delle infezioni parassitarie umane

                            d.    Principali parassiti di interesse medico:

                                                                      i.    Protozoi e parassitosi intestinali (Giardia, Entamoeba, Cryptosporidium)

                                                                    ii.    Protozoi e parassitosi ematiche e in altre sedi (Trypanosoma, Leishmania, Trichomonas, Plasmodium, Toxoplasma)

                                                                   iii.    Metazoi (Taenia saginata e Taenia solium, Ascaris lumbricoides, Enterobius vermicularis)

                            5.    Cenni di diagnostica delle parassitosi e loro controllo

                            a.    Parassiti ematici

                            b.    Parassiti enterici

                            c.    Parassiti tissutali

                            d.    Principali farmaci e vaccini

                             


                            Testi di riferimento

                            Edizioni più recenti

                            1. Microbiologia Medica -  Murray P. R., Rosenthal K.S., Pfaller M. A. - Casa Editrice EDRA
                            2. Principi di microbiologia medica -  Antonelli G., Clementi M., Pozzi G., Rossolini G.M. - Casa Editrice Ambrosiana
                            3. Principi di microbiologia medica - La Placa M. Edises

                            I libri contrassegnato con il numero 1 e 2 sono  quello annotati alle sezione "programmazione". Eventuali approfondimenti, non obbligatori, saranno segnalati nella sezione "programmazione"

                            Lo studente è comunque libero di scegliere qualsiasi altro libro di testo

                            Programmazione del corso

                             ArgomentiRiferimenti testi
                            1Modulo di Batteriologia: Batteri di interesse medicoMurray Ed. VIII, cap. 12, 13. Antonelli III ed. cap. 2 e parte del 4, 5. [integrazione non obbligatoria, ma consigliata: Prescott. Ed. VI, cap. 9-10]
                            2Modulo di Batteriologia: La patogenesi dell’infezione batterica - Relazione ospite-parassitaMurray Ed. VIII, cap. 1, 2 7, 8, 10, 14, 15. Antonelli IIl ed. cap. 6, 7, 10 [integrazione non obbligatoria, ma consigliata: Prescott. Ed. VI, cap.27, 32, 35]
                            3Modulo di Batteriologia: Il controllo dell’infezione - La profilassi immunitariaMurray Ed. VIII, cap. 3, 11, 17. Antonelli III ed. cap 9, 33, 76
                            4Modulo di Batteriologia: La batteriologia specialeMurray Ed. VIII, cap. dal 18° al 35°. Antonelli III ed. cap dal 11° al 31
                            5 Modulo di batteriologia: I principi di diagnostica delle infezioni da batteri, test di sensibilità fenotipici e molecolari Murray Ed. VIII, cap. 4, 5, 6, 16. Antonelli III ed. cap. 8
                            6Modulo di virolgia: I virus e le strutture sub viraliMurray Ed. VIII, cap. 36, 56. Antonelli III ed. cap 34-36, 66
                            7Modulo di virologia: La patogenesi dell’infezione viraleMurray Ed. VIII, cap. 37, 38. Antonelli III ed. 37-39, 65
                            8Modulo di virologia: Il controllo delle infezioni viraliMurray Ed. VIII, cap. 40 (vedi Studium per integrazione). Antonelli III ed. cap. 67-69
                            9Modulo di virologia: I principi di diagnostica delle malattie viraliMurray Ed. VIII, cap. 39. Antonelli III Ed. cap. 40 (Vedi studium per integrazione)
                            10Modulo di virologia: Caratteristiche dei principali virus di interesse medicoMurray Ed. VIII, cap. dal 41° al 55°. Antonelli III ed. cap dal 41° al 64° (Vedi studium per integrazione)
                            11Modulo di Micologia e Parassitologia: Caratteristiche generali dei miceti, azione patogena e classificazione delle micosi  Murray Ed. VIII, cap. 57, 58, 59 - Antonelli III ed. cap. 14, 71 (Vedi studium per integrazione)
                            12Modulo di Micologia e Parassitologia: I funghi responsabili di micosiMurray Ed. VIII, cap. dal 60, 62° al 67°. Antonelli III ed. cap. 72 (Vedi studium per integrazione)
                            13Modulo di Micologia e Parassitologia: I farmaci antifunginiMurray Ed. VIII, cap. 61. Antonelli III ed. cap 73 (Vedi studium per integrazione)
                            14Modulo di Micologia e Parassitologia: I ParassitiMurray Ed. VIII, cap. 68-70, 73-77 (Prescott. Ed. VI, cap. 38). Antonelli III ed. cap 74 fino a D-56 (Vedi studium per integrazione)
                            15Modulo di Micologia e Parassitologia: Cenni di diagnostica delle parossitosi e loro controlloMurray Ed. VIII, cap. 71, 72 (Vedi studium per integrazione)

                            Verifica dell'apprendimento

                            Modalità di verifica dell'apprendimento

                            La verifica di Microbiologia è mirata a valutare il livello di conoscenza in merito a quanto previsto dagli obiettivi formativi specifici, la capacità di sapere applicare le conoscenze di base acquisite alla clinica (implicazioni microbiologiche) e per la risoluzione di problemi specifici inerenti le relazioni tra il patogeno e l’ospite

                            La prova si svolge tramite un esame orale.

                            L’esame orale consiste in un colloquio in cui saranno poste n.2-3 domande che vertono su almeno n. 3 diversi argomenti del programma (batteriologia, virologia e micologia). La prova permette di verificare: i) il livello di conoscenza in merito ai principali microrganismi patogeni umani; ii) la capacità di applicare tali conoscenze per definire la virulenza e il potere patogeno in infezioni umane, nonché’ le principali modalità del controllo dell’infezione stessa; iii) la chiarezza espositiva; iv) la proprietà di linguaggio medico-scientifico.

                            Per l’attribuzione del voto dell’esame orale si terrà conto dei seguenti parametri:

                            Voto 29-30 e lode: lo studente ha una conoscenza approfondita dei principali microrganismi patogeni; dei meccanismi di virulenza, della capacità di dare infezione e dei metodi di controllo dell’infezione stessa; riesce prontamente e correttamente a integrare e analizzare criticamente le situazioni presentate, risolvendo autonomamente problemi anche di elevata complessità; ha ottime capacità comunicative e padroneggia il linguaggio medico-scientifico.

                            Voto 26-28: lo studente ha una buona conoscenza dei principali microrganismi patogeni; dei meccanismi di virulenza, della capacità di dare infezione, e dei metodi di controllo dell’infezione stessa, riesce a integrare e analizzare in modo critico e lineare le situazioni presentate, riesce a risolvere in modo abbastanza autonomo problemi complessi ed espone gli argomenti in modo chiaro utilizzando un linguaggio medico-scientifico appropriato.

                            Voto 22-25: lo studente ha una discreta conoscenza dei principali microrganismi patogeni; dei meccanismi di virulenza, della capacità di dare infezione, e dei metodi di controllo dell’infezione stessa, anche se limitata agli argomenti principali; riesce a integrare e analizzare in modo critico ma non sempre lineare le situazioni presentate ed espone gli argomenti in modo abbastanza chiaro con una discreta proprietà di linguaggio.

                            Voto 18-21: lo studente ha la minima conoscenza dei principali microrganismi patogeni; dei meccanismi di virulenza, della capacità di dare infezione, e dei metodi di controllo dell’infezione stessa, ha una modesta capacità di integrare e analizzare in modo critico le situazioni presentate ed espone gli argomenti in modo sufficientemente chiaro sebbene la proprietà di linguaggio sia poco sviluppata.

                            Esame non superato: lo studente non possiede la conoscenza minima richiesta dei contenuti principali dell’insegnamento. La capacità di utilizzare il linguaggio specifico è scarsissima o nulla e non è in grado di applicare autonomamente le conoscenze acquisite.

                             La verifica dell’apprendimento potrà essere effettuata anche per via telematica,
                            qualora le condizioni lo dovessero richiedere.

                             Informazioni per studenti con disabilità e/o DSA:

                            A garanzia di pari opportunità̀ e nel rispetto delle leggi vigenti, gli studenti interessati possono chiedere un colloquio personale in modo da programmare eventuali misure compensative e/o dispensative, in base agli obiettivi didattici ed alle specifiche esigenze.

                            È possibile rivolgersi anche al docente referente CInAP (Centro per l’integrazione Attiva e Partecipata - Servizi per le Disabilità e/o i DSA)

                             

                            Esempi di domande e/o esercizi frequenti

                            Caratteristiche generali di microrganismi di interesse medico.

                            Meccanismi patogenetici di microrganismi.

                            Principali farmaci e vaccini ad attività antimicrobica. Immunizzazione passiva ed attiva.

                            Descrizione dei principali gruppi microbici.

                            Caratteristiche biologiche ed azione patogena dei microrganismi e parassiti patogeni per l’uomo.


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