Richiami di termodinamica, cinetica e spettroscopia, struttura dell’acqua liquida, effetto idrofobico, cristalli liquidi.
Differential Scanning Calorimetry: Principi, applicazioni alle transizioni conformazionali.
Dicroismo Circolare: Principi, applicazioni alla determinazione delle strutture secondarie delle proteine.
Termodinamica statistica: Fattore di Boltzmann, probabilità di un sistema, funzione di partizione.
Dinamica Molecolare: Principi, force field, AA-MD, CG-MD, SMD, REMD, TI-MD, FEP-MD, analisi dati.
NMR stato solido: Principi, Spinning Magic Angle, 31P e 2H.
ESR: Principi, Spin-label.
Diffrazione di raggi-X: Principi, determinazione della struttura tridimensionale di proteine.
Trasformata di Fourier: Proprietà della TF e anti TF, applicazioni alle spettroscopie NMR e IR e alla diffrazione a raggi-X.
Membrane biologiche: fosfolipidi, monolayer e bilayer e fenomeni di self-assembling, struttura di bilayer fosfolipidici, transizioni di fase gel-cristallo liquido, caratterizzazione strutturale di bilayer, caratterizzazione dinamica di bilayer fosfolipidici, membrane modello, caratterizzazione spettroscopica e termodinamica di bilayer fosfolipidici.
Proteine: struttura e proprietà di amino acidi, legame peptidico, struttura delle proteine, plot di Ramachandran, problema del folding, modello di Lumry-Eyring, determinazione tridimensionale di strutture proteiche, dinamica delle proteine, interazioni membrana proteina, caratterizzazione spettroscopica e termodinamica di sistemi proteici. Proteine amiloidogeniche, amiloidi tossici ed amiloidi funzionali, struttura degli amiloidi, interazione di proteine amiloidogeniche con bilayer fosfolipidiche.
Acidi Nucleici: struttura e proprietà di DNA e RNA, interazione con piccole molecole, fasi liquido cristalline, sistemi modello, caratterizzazione spettroscopica e termodinamica.
Autore | Titolo | Editore | Anno | ISBN |
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C. La Rosa | Appunti |
Argomenti | Riferimenti testi | |
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1 | Richiami di termodinamica, cinetica e spettroscopia, struttura dell’acqua liquida, effetto idrofobico, cristalli liquidi. | Gli studenti saranno forniti degli appunti di tutte le lezioni all'inizio del corso |
2 | Differential Scanning Calorimetry: Principi, applicazioni alle transizioni conformazionali. Dicroismo Circolare: Principi, applicazioni alla determinazione delle strutture secondarie delle proteine. | Gli studenti saranno forniti degli appunti di tutte le lezioni all'inizio del corso |
3 | Termodinamica statistica: Fattore di Boltzmann, probabilità di un sistema, funzione di partizione. Dinamica Molecolare: Principi, force field, AA-MD, CG-MD, SMD, REMD, TI-MD, FEP-MD, analisi dati. | Gli studenti saranno forniti degli appunti di tutte le lezioni all'inizio del corso |
4 | NMR stato solido: Principi, Spinning Magic Angle, 31P e 2H. ESR: Principi, Spin-label. Diffrazione di raggi-X: Principi, determinazione della struttura tridimensionale di proteine. Trasformata di Fourier: Proprietà della TF e anti TF, applicazioni alle spettroscopie NMR e IR e alla diffrazione a raggi-X. | Gli studenti saranno forniti degli appunti di tutte le lezioni all'inizio del corso |
5 | Membrane biologiche: fosfolipidi, monolayer e bilayer e fenomeni di self-assembling, struttura di bilayer fosfolipidici, transizioni di fase gel-cristallo liquido, caratterizzazione strutturale di bilayer, caratterizzazione dinamica di bilayer fosfolipidici, membrane modello, caratterizzazione spettroscopica e termodinamica di bilayer fosfolipidici. | Gli studenti saranno forniti degli appunti di tutte le lezioni all'inizio del corso |
6 | Proteine: struttura e proprietà di amino acidi, legame peptidico, struttura delle proteine, plot di Ramachandran, problema del folding, modello di Lumry-Eyring, determinazione tridimensionale di strutture proteiche, dinamica delle proteine, interazioni membrana proteina, caratterizzazione spettroscopica e termodinamica di sistemi proteici. Proteine amiloidogeniche, amiloidi tossici ed amiloidi funzionali, struttura degli amiloidi, interazione di proteine amiloidogeniche con bilayer fosfolipidiche. | Gli studenti saranno forniti degli appunti di tutte le lezioni all'inizio del corso |
7 | Acidi Nucleici: struttura e proprietà di DNA e RNA, interazione con piccole molecole, fasi liquido cristalline, sistemi modello, caratterizzazione spettroscopica e termodinamica. | Gli studenti saranno forniti degli appunti di tutte le lezioni all'inizio del corso |
Parametro d'ordine
Struttura delle Proteine
Spettroscopia NMR stato solido
Probe fluorescenti
amiloidi