LABORATORIO DI INFORMATICA

2 CFU - 1° semestre

Docente titolare dell'insegnamento

FRANCESCO PAPPALARDO
Email: francesco.pappalardo@unict.it
Edificio / Indirizzo: Dipartimento di Scienze del Farmaco, Piano 2
Telefono: 0957384223
Orario ricevimento: Lunedì 12-14, studenti; Venerdì 12:30-13:30, tesisti e tirocinanti


Obiettivi formativi

Acquisire i concetti fondamentali dell’informatica, e una conoscenza globale dei sistemi di programmazione e del processo di reasoning. Conoscere il concetto di algoritmo e capacità di identificare i principi fondamentali ad esso associato.
Conoscere i metodi computazionali applicati alla modellazione dei sistemi biologici.


Modalità di svolgimento dell'insegnamento

Lezioni pratiche


Prerequisiti richiesti

Aver frequentato il corso di Principi di informatica e matematica applicati alle biotecnologie



Frequenza lezioni

Obbligatoria



Contenuti del corso

  1. Uso ed accesso dei maggiori database genomici, proteinomici e bibliografici
  2. Esempi pratici di bioinformatica classica: assemblaggio di frammenti genomici, analisi e allineamento di biosequenze
  3. Protege e le ontologie: cenni
  4. COPASI: modellazione molecolare
  5. Modelli ad agenti: netlogo e sistemi customs


Testi di riferimento

Appunti del docente


Altro materiale didattico

Presto disponibile



Programmazione del corso

 ArgomentiRiferimenti testi
1Uso ed accesso dei maggiori database genomici, proteinomici e bibliografici Esempi pratici di bioinformatica classica: assemblaggio di frammenti genomici, analisi e allineamento di biosequenze Protege e le ontologie: cenni COPASI: modellazione molecolare Modelli ad agenti: netlogo e sistemi customsAppunti del docente 


Verifica dell'apprendimento


MODALITÀ DI VERIFICA DELL'APPRENDIMENTO

Mediante esercizi pratici


ESEMPI DI DOMANDE E/O ESERCIZI FREQUENTI

Esercizi pratici




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