PROGETTAZIONE RAZIONALE DEL FARMACO

CHIM/08 - 6 CFU - 2° semestre

Docente titolare dell'insegnamento

SALVATORE GUCCIONE
Email: guccione@unict.it
Edificio / Indirizzo: Ed.2 Viale Andrea Doria 6, Città universitaria
Telefono: +39 095 738-4020
Orario ricevimento: Tutti i giorni previo contatto e-mail


Obiettivi formativi

Sinopsi: Il corso sarà focalizzato sulla presentazione di strategie per una più rapida ed efficace identificazione di potenziali candidati-farmaci . Sarà preso in esame lo sviluppo del farmaco dalla identificazione del target alla “selezione e validazione Hit-Lead” compreso lo sviluppo di relazioni struttura attività attraverso l’ utilizzo di metodi computazionali. Nel prosieguo del corso lo studente apprenderà sul riconoscimento molecolare e la progettazione supportata dal computer applicata allo sviluppo di nuovi farmaci.

Contenuti del corso e metodo di insegnamento

Obiettivi principali

Introdurre gli studenti alle tecniche di modellistica molecolare applicate a sistemi biologici ponendo l’ accento sui metodi utilizzati ed i loro aspetti teorici. Fornire allo studente le informazioni per raggiungere una comprensione di base dei metodi computazionali disponibili e delle loro basi teoriche e soprattutto per una scelta appropriata, critica e quanto più possibile funzionale al "sistema" in esame anche attraverso "specifici esempi" .

Conoscenza e comprensione

Avere comprensione del background teorico e dell’ applicazione della modellizzazione molecolare in chimica farmaceutica; capire le origini delle interazioni intermolecolari, come modellarle e come correlarle a dati sperimentali; valutare i vantaggi e gli svantaggi (abilità critica) di differenti metodologie di modellistica.

Principali risultati dell’ apprendimento

  1. Abilità ad implementare le sopramenzionate metodologie nella pratica; b) Abilità ad analizzare un certo problema e selezionare un adatto metodo computazionale per studiarlo; (c) Abilità cognitive: la sfida chiave per questo corso è la capacità per gli studenti di pianificare e sviluppare uno studio di modellistica molecolare . Gli studenti inoltre saranno in grado di interpretare l’ analisi statistica ed i risultati nonchè le relazioni con gli esperimenti di laboratorio; d)abilità professionali specifiche: capacità ad utilizzare la modellistica molecolare per risolvere specifici problemi e per valuare criticamente dati ed articoli.

Modalità di svolgimento dell'insegnamento

Lezioni Frontali.

Qualora l'insegnamento venisse impartito in modalità mista o a distanza potranno essere introdotte le necessarie variazioni rispetto a quanto dichiarato in precedenza, al fine di rispettare il programma previsto e riportato nel syllabus.


Prerequisiti richiesti

Chimica Organica; Biochimica



Frequenza lezioni

E' obbligatoria la frequenza delle lezioni in accordo con il Regolamento Didattico di Ateneo (R.D.A.).

Qualora l'insegnamento venisse impartito in modalità mista o a distanza potranno essere introdotte le necessarie variazioni rispetto a quanto dichiarato in precedenza, al fine di rispettare il programma previsto e riportato nel syllabus.



Contenuti del corso

  1. LIBRI DI TESTO ED ALTRE RISORSE

Considerati i rapidi avanzamenti nel campo della modellistica molecolare, non è stato possibile identificare un singolo testo primario che copra adeguatamente il contenuto di questo corso. Di conseguenza, il docente fornirà agli studenti risorse addizionali per integrare il materiale (appunti) della lezione. Queste risorse potranno avere”forma” di libro, articoli di riviste (se disponibile il link elettronico a dette risorse sarà reso disponibile) o essere “web based”.



Testi di riferimento

Appunti delle lezioni; Dispensa di Chemiometria; Articoli forniti dal docente.


Altro materiale didattico

Appunti delle lezioni; Dispensa di Chemiometria; Articoli forniti dal docente.



Programmazione del corso

 ArgomentiRiferimenti testi
1Vedi ProgrammaAppunti delle Lezione e materiale didattico/bibliografico fornito dal docente 


Verifica dell'apprendimento


MODALITÀ DI VERIFICA DELL'APPRENDIMENTO

Esame orale

La verifica dell’apprendimento potrà essere effettuata anche per via telematica, qualora le condizioni lo dovessero richiedere.


ESEMPI DI DOMANDE E/O ESERCIZI FREQUENTI
  1. Dinamica Molecolare
  2. Algoritmi genetici: operatori genetici e significato
  3. Metodi di selezione dei descrittori e scaling
  4. Docking: Flessibilità delle proteine
  5. Farmacofori statici e dinamici
  6. Principio di Ergodicità
  7. Indice di Tanimoto
  8. Funzioni di Scoring
  9. Approcci MIF
  10. 2D-QSAR/3D QSAR
  11. Metodi MIF.
  12. Descrittori
  13. Multiple Protein Structure (MPS) ed applicazioni.
  14. Metodi Chemiometrici



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