Obiettivo del corso è l’acquisizione di metodi per l’analisi di sequenze e strutture biologiche e per la ricerca in database biologici (es. geni, sequenze, domini funzionali). Partendo da sequenze primarie di acidi nucleici o proteine è possibile ipotizzarne la funzione, la storia evolutiva e la struttura. Gli strumenti utilizzati per raggiungere questi obiettivi sono i database pubblici e i programmi di analisi e visualizzazione.
lezioni frontali
Nessuno.
Frequenza obbligatoria
Il corso è organizzato in lezioni che prevedono una base teorica affiancata a esercitazioni i per l’apprendimento dell’uso di programmi di analisi e visualizzazione dei risultati.
PROGRAMMA
Libri di testo
Sul portale studium.unict.it saranno forniti i lucidi delle lezioni.
Argomenti | Riferimenti testi | |
1 | Introduzione alla bioinformatica: tipi di dati, problemi, strumenti. | materiale didattico fornito dal docente |
2 | Sequenze, ricerca tramite BLAST, allineamento pairwise e multiplo. Algoritmi. | materiale didattico fornito dal docente |
3 | Esercitazioni su allineamento di sequenze | materiale didattico fornito dal docente |
4 | Banche dati biologiche generali di Entrez NCBI: Gene, Nucleotide, Protein, Pubmed | materiale didattico fornito dal docente |
5 | Esercitazioni su banche dati generali | materiale didattico fornito dal docente |
6 | Banche dati specializzate: OMIM, SNP, GO, KEGG, CIVIC e DrugBank | materiale didattico fornito dal docente |
7 | Esercitazioni su banche dati specializzate | materiale didattico fornito dal docente |
8 | Simulazioni di esame | materiale didattico fornito dal docente |
L'esame finale consiste in una prova scritta ed un colloquio orale.
La prova scritta è costituita da esercizi e domande di teoria.
Chi non supera la prova scritta, non può sostenere l'orale. La prova scritta può essere visionata prima delle prove orali.
Salvo diversa comunicazione:
Note:
Durante il corso saranno forniti diversi esercizi risolti che verranno pubblicati sul portale studium.unict.it